在我国一些经济不发达地区，其财政资金的运行存在一定的特殊性，如预算普遍赤字、资金管理缺乏效益性、预算科目之间的调剂等。鉴于此，审计部门在进行财政审计时应根据其特点，在增加收入合理安排支出方面发挥作用；把预算资金的效益审计作为重点；处理好预算执行审计和财政决算审计的关系等，并使该地区财政部门更好地发挥其职能作用。