农村集体经济审计是提高农村经济效益、维护农村经济秩序的有效保障。现行农村集体经济审计站审计的模式已经落伍，委托CPA审计的辅助模式也有很多弊端。基于国家审计机关主管的相对统一的“农村经济审计监督中心”的审计模式是农村集体经济审计模式的创新和发展。创新模式的运行保障机制主要有明确农村集体经济审计法律地位、建立配套的审计制度、规范审计程序、深化审计内容、拓展审计类型，提高审计能力、建立高素质的审计队伍。